Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms