Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms