Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms