Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms