Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms