Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms