Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms