Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms