Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms