Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms