Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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