Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD11Q9BXL7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms