Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms