Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms