Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms