Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms