Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms