Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms