Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3EQ6PEY2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms