Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms