Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms