Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RRN3P1Q2M238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RRN3P1Q2M238 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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