Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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