Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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