Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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