Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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