Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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