Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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