Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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