Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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NR1D2Q14995 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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NR1D2Q14995 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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NR1D2Q14995 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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