Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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