Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PWP1Q13610 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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