Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF5Q13568 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms