Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms