Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SNTB2Q13425 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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