Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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