Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms