Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms