Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms