Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms