Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms