Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms