Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMFBP60983 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms