Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC4P56524 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms