Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP3P50461 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSRP3P50461 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms