Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms