Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms