Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms