Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMGB2P26583 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms