Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPREP23469 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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